生物信息学/R语言在生物信息学的应用
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生信分析相关的R包
[编辑]reshape：长短数据转换
[编辑]reshape：http://had.co.nz/reshape/
https://cran.r-project.org/web/packages/reshape2/index.html
ggvis可视化：https://ggvis.rstudio.com/
shiny类
[编辑]shiny的UI进阶设计：https://unleash-shiny.rinterface.com/
shiny和SQL数据库：https://bookdown.org/msharkey3434/ShinyDB_Book/
R, plotly, shinyR, plotly和shiny：https://plotly-r.com/
相关书籍/资料
[编辑]数据分析残卷：https://bookdown.org/yufree/datadown/
bookdown：https://bookdown.org/
http://cran.r-project.org/doc/contrib/Short-refcard.pdf
RStudio Cheatsheets：https://www.rstudio.com/resources/cheatsheets/
R函数在线参考文档：https://rdrr.io/
- Statistical tools for high-throughput data analysis：http://www.sthda.com/english/
- R语言与统计生物信息学：
- R Bioinformatics Cookbook，使用 R 和 Bioconductor 执行 RNAseq、基因组学、数据可视化和生物信息学分析：https://www.packtpub.com/product/r-bioinformatics-cookbook/9781789950694
免费视频课程
[编辑]Bioconductor
[编辑]- Bioconductor课程：http://www.bioconductor.org/help/course-materials/
- 斯坦福的Bioconductor课程：https://web.stanford.edu/class/bios221/about.html
- Biostars的R专题：https://www.biostars.org/t/R/
- R编程：https://www.youtube.com/c/RProgrammingDDS
- 【生信技能树】生信人应该这样学R语言：https://www.bilibili.com/video/av25643438
- 【生信技能树】公共数据库挖掘实例（基于R语言）：https://www.bilibili.com/video/av37568990
- R语言入门生信应用基础课程：https://study.163.com/course/courseMain.htm?courseId=1209044861
- R语言入门数据分析：https://ke.qq.com/course/366588
- 生物信息学入门基础讲座的R部分：https://ke.qq.com/course/270841
- PlottinginRforBiologists：https://marianattestad.com/blog