在人類和其他動物中，呼吸系統的解剖特徵包括「氣道」，「肺」和呼吸肌。
其他動物，例如昆蟲，其呼吸系統具有非常簡單的解剖特徵，在兩棲動物中，甚至皮膚在氣體交換中也起著至關重要的作用。
植物也有呼吸系統，但是氣體交換的方向可能與動物相反。植物的呼吸系統還包括解剖學特徵，例如被稱為「氣孔」的葉片下側的孔。
在哺乳動物中，「 橫隔膜」將體腔分為：
